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Bioinformatique

A propos de ce cours

Le MOOC BIG : BioInformatique pour la Génétique médicale a pour vocation d’aborder l’ensemble des aspects bioinformatiques nécessaires à la production et à l’interprétation de données du séquençage haut débit (ou NGS) au sein d’un laboratoire de génétique médicale agréé. L’objectif est de fournir des contenus concrets et adaptés au public des généticiens souhaitant comprendre les les différentes étapes bioinformatiques (pipeline) de leur laboratoire et leur permettre d’avoir un oeil critique sur leurs analyses.

Cet enseignement a deux objectifs principaux :

  • Former des généticiens à la bio-informatique et à la bio-analyse
  • Participer à la création d'une communauté de médecins généticiens et de bio-informaticiens de génétique médicale

Objectifs pédagogiques

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Public et Prérequis

Une connaissance de la génétique fondamentale est nécessaire pour comprendre le contenu de l'enseignement.

Ce MOOC est destiné principalement :

  • aux internes en DES de génétique médicale, du DES de biologie médicale ayant choisir l'option génétique ou autres internes des autres DES intéressés par la discipline
  • aux étudiants en bioinformatique voulant s'orienter vers la génétique médicale
  • aux généticiens médicaux en exercice
  • aux bioinformaticiens avec une activité orientée en génétique médicale

Thématiques

  • Thème 1 : Comprendre la révolution du NGS en génétique médicale
  • Thème 2 : Interprétation biologique d’un variant
  • Thème 3 : Variant calling
  • Thème 4 : Alignement
  • Thème 5 : Base caliing

Coordination pédagogique

Course Staff Image #1

Kévin YAUY

DES de Génétique Médicale

Course Staff Image #1

Evan GOUY

DES de Génétique Médicale

Course Staff Image #1

Julien THEVENON

DES de Génétique Médicale

Intervenants

cf MOOC Planète Apprenante pour le slider

Plan du cours

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Format

Pour cette session, le MOOC a lieu sur a lieu sur 6 semaines dont une semaine de découverte. Il est possible de le suivre de façon totalement autonome mais il sera rythmé de façon hebdomadaire.

Chaque module contient un parcours comportant différentes ressources d'apprentissage et des exercices

Un forum est dédié aux échanges entre apprenants. Il sera utilisé pour garder contact avec les différents apprenants.

Une attestation de réussite à ce MOOC sera disponible si l'apprenant réussit 75% des exercices. Il n'apporte pas de certification pour le moment.

Objectifs pédagogiques

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Réseaux sociaux et Communauté

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La communauté sera accessible bientôt.

Partenaires

AnDDI Rares

SFMPP

CRI

Équipe technique


Photo de
Xavier Desplas
Réalisateur.
Photo de
Fabien Hobart
Ingénieur pédagogique.
Photo de
Hugo Lopez
Ingénieur plateformes.
Photo de
Alexis Royneau
Assistant réalisateur.
Photo de
David Pontalier
Ingénieur pédagogique.

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